Vaginálny ekosystém je prirodzené osídlenie pošvy baktériami. Ide najčastejšie o špeciálne (vaginálne – prispôsobené životu vo vagíne) kmene laktobacilov, ktoré produkujú kyselinu mliečnu a tým znižujú kyslosť (pH) vaginálneho prostredia (čím vytvárajú podmienky nehostinné pre „nepriateľské“ baktérie). Vaginálne laktobacily ďalej vyrábajú peroxid vodíka, ktorý chráni ako pred rozmnožením anaeróbnych „nepriateľských“ baktérií, tak aj kvasiniek (pôvodcovia mykóz). Laktobacily si vytvárajú na svojej bunkovej stene bakteriocíny, látky, ktoré brzdia rast iných baktérií.

Vaginálne kapsuly by sa nemali používať v čase menštruácie. Používanie v tehotenstve konzultujte s lekárom.